Tout commença, il y avait 13 ans au château d’Heinstein en Allemagne. La jeune Pandore âgée de 3 ans ouvrit la boîte contenant l’âme d’Hypnos et Thanatos. Elle rompit ainsi le sceau d’Athéna actif depuis plus de 200 ans. Les deux esprits informèrent la petite fille que sa mère allait bientôt mettre au monde Hadès, le roi des ténèbres, et qu’elle devrait s’occuper de lui jusqu’au moment où les 108 spectres se réveilleraient, en échange elle recevrait la vie éternelle.
13 ans plus tard la guerre sainte entre Hadès et Athéna arriva à son dénouement, les 108 spectres moururent, mais Hadès enleva Athéna et l’emmena à Elysion. Les jeunes chevaliers de Bronze se jetèrent alors à la poursuite du Dieu des Enfers.
Thanatos fut alerté par des elfes effrayées, en effet un homme couvert de sang et de sueur se trouvait à Elysion. Impossible !! « C’est comme si un démon des Enfers s’était égaré à Elysion ».
Thanatos alla à la rencontre de cet individu qui n’était autre que Seiya.
Le Dieu de la mort annonça au jeune japonais qu’Athéna était morte ! Seiya, fou de rage, essaya d’attaquer le Dieu mais Thanatos le neutralisa d’un seul geste.
Au moment où Thanatos voulut achever le chevalier, son frère Hypnos, dieu du Sommeil, apparut. Ce dernier lui dit qu’il considérait la vie et la mort avec trop de légèreté, il le blâma aussi d’avoir tué Pandore. Enfin il lui révéla qu’Athéna n’était pas tout à fait morte mais qu'elle avait été plongée dans le sommeil d’Hypnos et que son corps se trouvait dans le palais d’Hadès.
Sur ces aveux Seiya se précipita vers le palais, mais Thanatos souhaita le tuer afin qu’il ne souillât pas d’avantage la terre pure d’Elysion. Thanatos envoya une énorme boule de feu sur Seiya mais celui-ci l’évita grâce aux ailes qui lui firent faire un bond spectaculaire. Pégase contre-attaqua avec ses météores. Thanatos blessé dans son orgueil pulvérisa les ailes de Seiya. Hypnos le laissa seul en l’avertissant : « on dit parfois que la souris peut mordre le chat ». Thanatos s’approcha de Seiya à terre, celui-ci se relèva brusquement et lança sa comète de Pégase presque à bout portant avec l’énergie du désespoir, mais elle n’affecta pas le moins du monde Thanatos.
Soudain celui-ci s’aperçut qu’il portait une trace de sang, fou de rage il se mit à frapper Seiya, mais la mort physique de Pégase ne suffit pas à Thanatos. Il voulait d’abord faire souffrir l’âme de Seiya pour assouvir sa soif de vengeance.
Au même moment au sanctuaire Seika, la sœur de Seiya, apparut. Marine raconta alors aux autres qu’elle était amnésique. Thanatos voulut alors tuer Seika avec une attaque inter-dimensionnelle mais pour que Seiya souffrit il lui permit de la voir : Seiya la reconnut immédiatement. Thanatos lança son attaque mais Shina, Marine, Kiki, Jabu et les autres chevaliers de Bronze se servirent de leur corps pour protéger Seika. Seiya utilisa son dernier atout sur Thanatos : le tourbillon de Pégase. Cependant, Pégase encaissa seul l’attaque. Thanatos voulut l’achever mais la chaîne d’Andromède l’en empêcha. Pour la première fois dans Hadès, les 5 chevaliers de Bronze étaient réunis. Néanmoins, il se firent tous terrasser par Thanatos.
Au moment où tout espoir semblait perdu Thanatos ressentit un cosmos gigantesque, il s’agissait de celui d’un dieu ! En effet, c’était l’âme de Poséidon qui envoyait aux chevaliers 5 armures d’or celles du Sagittaire, de la Balance, du Verseau, de la Vierge et du Lion. Les 5 chevaliers de Bronze étaient devenus des chevaliers d’or ! Toutefois Thanatos envota son « Terrible Providence » et réduisit les armures d’Or en miettes d’un seul coup. Tout semblait perdu pour les chevaliers d’Athéna, mais Seiya se releva et comme par miracle l’armure divine de Pégase vint le protéger. Thanatos qui n’était pas impressionné tenta de tuer Seiya, mais le chevalier prit le dessus et lança ses météores qui détruisirent Thanatos et son armure.
Thanatos est le parfait stéréotype du méchant dans Saint Seiya : sûr de sa force, ne jugeant son adversaire que sur l’apparence. C’est d’ailleurs ce qui lui coûtera la vie. Comme le dit Seiya, Thanatos n’est rien de plus qu’un demi-dieu dont le seul amusement est de jouer avec la mort. Mais que peut-on faire face à un adversaire qui se bat avec l’énergie du désespoir comme Pégase ?
Hypnos est l’opposé de son frère Thanatos, posé, réfléchi, il ne sous-estime pas ses adversaires et prend conscience de leur valeur.