Les sources historiques attribuent diverses origines à la constellation du Verseau.

Suivant les légendes homériques, Ganymède était soit le fils de Tros, fondateur de Troie, soit de Laomédon, père du roi troyen Priam. Étant d’une grande beauté, il fut enlevé par les dieux et vécut parmi eux, servant d'échanson à Zeus. Il était donc le serviteur préposé au nectar et à l'ambroisie des dieux. Cette boisson, véritable nourriture des dieux, leur conférait l'immortalité et la jeunesse éternelle. Une autre version fait de Ganymède le captif du seigneur de l'Olympe, qui, selon les versions, l'enleva dans un tourbillon, en chargea un de ses aigles ou se changea lui-même en aigle pour l’enlever. Puis il envoya Hermès avertir le père de l'enfant de l'honneur qui avait été accordé à son fils. En récompense, il offrit au père deux juments immortelles desquelles descendait l'écurie royale de Troie, et un ceps en or, œuvre d'Héphaïstos. Zeus devint l'amant de Ganymède et le fixa plus tard au firmament, faisant de lui la constellation du Verseau, le porteur d'eau. Il plaça la constellation de l'Aigle à côté.

D'autres auteurs expliquent qu’il existait dans la mythologie grecque un terrible ennemi des dieux nommé Typhon. Celui-ci les attaqua et les poussa à fuir l'Olympe où seul Zeus, assisté de sa fille Athéna, resta pour le combattre. Après un âpre combat où le dieu fut blessé, Typhon fut terrassé et tomba dans l'océan, ce qui créa un gigantesque raz-de-marée. Le Verseau fut la personne chargée par Zeus d'éponger l'eau de la surface de la Terre.

Enfin, certains associent le Verseau au mythe de Deucalion, fils de Prométhée et époux de Pyrrha, elle-même fille d’Épiméthée et de Pandore. Zeus, déçu par le détestable caractère des hommes, provoqua un déluge afin de les anéantir. Prométhée, sachant ce qui se tramait, conseilla à son fils Deucalion de construire une embarcation lui permettant, à lui et à son épouse, de s’abriter pendant les neuf jours et les neuf nuits que dureraient les inondations. Il en fut fait ainsi, et quand le déluge se termina, le bateau s’échoua sur le mont Parnasse. Deucalion et Pyrrha virent alors qu’ils étaient les seuls survivants de l’espèce humaine. Zeus leur envoya Hermès qui leur permit de formuler un vœu ; leur désir fut de voir renaître l’humanité. Le maître de l’Olympe leur conseilla alors de jeter les os de leur mère par-dessus leurs épaules en se voilant la tête et en dénouant leur ceinture. D’abord choqués par le sacrilège que le dieu leur demandait de commettre, Deucalion et Pyrrha comprirent que leur « mère » était en fait leur « Grande Mère la Terre », et que les os n’étaient rien d’autre que des pierres. De celles lancées par Deucalion naquirent les hommes et de celles jetées par Pyrrha les femmes. Plus tard, le couple eut des enfants, dont Hellen, qui laissa son nom au peuple grec. Hellen et sa femme Orséis ont donné naissance aux ancêtres des trois grands peuples de la Grèce : Doros est l’ancêtre des Doriens, Éole, le père des Éoliens, et Xouthos donnera naissance aux Ioniens et aux Achéens.

La constellation du Verseau représenterait donc Deucalion, et l’eau qu’il verse serait l’eau du déluge.